Os cursos profissionalizantes da Casa de Passagem são voltados para o aumento da inclusão social de jovens de comunidades de baixa renda, através de sua incersão ao mundo do trabalho e geração de renda. Os cursos são oferecidos de acordo com a demanda social, em turmas de 20 alunos.

Todos os cursos têm um núcleo temático que se repete: desenvolvimento profissional, estímulo à leitura, redação e raciocínio lógico, a fim de dar um maior suporte para o aprendizado profissional, principalmente para aqueles que se encontram em situação de desvantagem em matemática, como também para aqueles que têm dificuldades em ler e escrever o português fluentemente.

O Programa Iniciação ao Trabalho desenvolve junto a sua equipe multidisciplinar os cursos que são oferecidos ao longo do ano. Em 2008 a Casa de Passagem ofereceu 13 cursos de formação profissional no Programa Iniciação ao Trabalho e em quatro comunidades atendidas pela instituição. Foram 388 adolescentes e jovens capacitados, sendo 72% do sexo feminino e 28% do sexo masculino. Mais de 100 alunos foram encaminhados ao mundo do trabalho.